绿茶中的儿茶素还可以杀菌。制作组以日本的各种引发食物中毒的细菌为对象进行了实验。在有细菌的培养液里，放入绿茶后，大部分细菌都消失了。虽然放置的时间和培养液的浓度有所差异，但是可以观察到绿茶对引发食物中毒菌的杀菌效果。
成为食物中毒最大原因的沙门氏菌的细胞膜溶解了，大肠菌穿透细胞造成肠道出血。喝一升左右的普通绿茶，在三四个小时内就可以杀死一万多个细菌。事实上位于日本茶叶栽培区的金泽小学，自从在集体就餐时提供绿茶后，食物中毒的事件明显减少了。
还有报道说绿茶可以减少口腔内细菌，防止口中产生异味，还能预防蛀牙。
